协和之所以不愿意并入清华，主要是由于北京协和医学院的特殊身份。

众所周知，北京协和医学院并非一所普通的医学院校，它不但是直属于卫健委的高校，还与中国医学科学院实行院校合一的管理体制。老师认为，北京协和医学院选择不并入清华大学，主要是出于自身发展的考虑，并不是如网上所说的那样“与清华大学合作不顺”。